自动化实验室规划设计原则与传统医学实验室相比，安装了流水线系统实验室在自动化程度上大大提高，同时在实验室设计方面也有更高的要求，以保证各仪器能够发挥最大效能，做到真正意义上的自动化。现就该实验室的经验，自动化实验室设计应本着以下几点原则：（1）积极参与，实验室的使用者应积极参与实验室规划设计，向施工方提出具体设计要求，使局部细节更适合该实验室工作需要；（2）及早着手，尽量避免后期重复施工，在实验室开始建设前就应考虑实验室整体规划，形成详细实验室布局图，并与施工单位讨论规划细节，这就要求实验室仪器设备招标提前进行，尽早确定仪器厂家型号，规划各仪器摆位，为后续规划提供依据；（3）有效沟通，实验室的建立离不开与各方面的合作，设计过程中应与施工单位、lis公司、仪器设备厂家、医院信息科、医院器材科等部门多联系建立良好的沟通渠道，设计要求应多咨询专业工程师；（4）学习经验，国内已建成的自动化实验室有各自设计特点，同时也有不足之处，取长补短能够使实验室规划少走弯路，该实验室规划期间主要借鉴了济南军区总医院、福州军区总医院、解放军305医院等兄弟单位经验；（5）考虑自身特点，每家医院实验室面积、标本量、检测项目、检测时间等各方面要求都有所不同，应根据自身特点进行规划设计。
自动化实验室规划设计sicolab2自动化实验室布局及工作流程设计该院在2008年初开始启动引进自动化流水线的前期准备工作，2010年3月批量检测标本，科室人员参与了规划设计的大量工作，通过近一年的运行也表明前期设计方案合理，工作流程顺畅。图1为该院检验科实验室整体布局图，污染区、半污染区（缓冲区）、清洁区在图中用不同颜色标出。
中心长方形区域为自动化实验室，由前室、中心机房及后部5个功能房间组成。前部75平方米为前室，有标本物流接收口，可进行标本核收、标本初步分选、线下标本离心等操作；中部275平方米为中心机房，机房又分为自动化流水线和线下仪器两部分，线下仪器区包含了为将来实验室发展预留的边台，实验室建成一年内又陆续引进了多台新设备，大部分预留空间已被利用；实验室后部为5个10平方米左右小房间，依次为供电房、水机房、低温标本库、低温试剂库、常温试剂库。核心工作区相对独立，不进行标本操作，主要是结果审核、表格填写、报告发送、资料查询等工作，工作人员可通过与实验区连接的大玻璃窗观察仪器状态，及时处理设备报警。